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  1. 02 研究紀要
  2. 第23号(2020)

天然変性領域予測におけるプロリンの重要性

https://maebashi-it.repo.nii.ac.jp/records/408
https://maebashi-it.repo.nii.ac.jp/records/408
a8ff0e3b-2841-4050-8484-6a127e2d12e7
名前 / ファイル ライセンス アクション
23_04.pdf 23_04 (691.4 kB)
Item type 紀要論文 / Departmental Bulletin Paper_02(1)
公開日 2022-03-22
タイトル
タイトル 天然変性領域予測におけるプロリンの重要性
タイトル
タイトル The importance of proline residues for the prediction of intrinsically disordered regions
言語 en
言語
言語 jpn
キーワード
主題 生命情報学
キーワード
主題 天然変性タンパク質
キーワード
主題 機械学習
キーワード
言語 en
主題 Bioinformatics
キーワード
言語 en
主題 Intrinsically Disordered Protein
キーワード
言語 en
主題 Machine Learning
著者 家富, 花奈

× 家富, 花奈

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安保, 勲人

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伊藤, 駿介

× 伊藤, 駿介

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福地, 佐斗志

× 福地, 佐斗志

福地, 佐斗志

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抄録
内容記述タイプ Abstract
内容記述 Intrinsically disordered regions (IDRs) can be predicted by computer programs. In this
work, we pursued what factors provide basis for predicting IDRs. We conducted a random
forest analysis to obtain degrees of con tribution of each of the amino acid residues for the
predictions . The result s suggested that the contribut ion of proline is remarkably larger than
other residues. Next, we analyzed the distribution of proline residues around the boundaries
between IDRs and structural domains (SDs) SDs), disclosing that proline residues notably
overrepresent in the SD sides of the boundaries. This result can contribute to develop more
accurate prediction program s and to understand the structural nature of intrinsically
disordered proteins.
書誌情報 前橋工科大学研究紀要

発行日 2020-03-31
ISSN
収録物識別子タイプ ISSN
収録物識別子 1343-8867
書誌レコードID
収録物識別子タイプ NCID
収録物識別子 AA11225201
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Ver.1 2023-06-20 14:10:20.516503
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